Statek federacji z prototypem nowego modelu "mobile suite'a" bezpiecznie dotarł na Ziemię. Niestety, po wylądowaniu okazuje się, że znalazł się w samym centrum wrogiego terytorium. Amuro Ray ponownie zmuszony zostaje do podjęcia walki z wrogiem. Tym razem jego przeciwnikiem będą nie tylko...
Przyszłość, w systemie słonecznym wybucha wojna, w której walczą ze sobą Ziemianie i koloniści. Zaledwie po tygodniu walk ginie połowa ludzkości. Jedyna szansa na ocalenie Ziemi przed podbiciem tkwi w tajnym projekcie V, który realizowany jest w bazie w kolonii Side 7. Naukowcy tam...