W Yokosuka rozpoczyna się konkurs pomiędzy innymi szkołami floty morskiej. Poznajemy Susan Reyes, która przybyła tam, aby pomóc piratom zablokować port i będąc przez nich oszukaną, zostaje ranna. Podczas festiwalu dowództwo szkoły głównych bohaterek otrzymuje powiadomienie, że grupa...
W 1945, Yoshika Miyafuji, która utraciła swoje moce wiedźmy podczas Strike Witches, studiuje, aby zostać lekarzem. Shizuka Hattori, jedna z jej uczennic w Imperial Fuso Navy, przybywa, aby dostarczyć wiadomość: Yoshika została przeniesiona na studia do Europy.
